O MHMPR conta com um vasto acervo de mais de 3.500 objetos, divididos em coleção médica, farmacêutica, sacra, histórica e outras. O acervo reúne objetos incríveis, como o pulmão de aço, e é fruto de uma parceria entre a Santa Casa de Curitiba e a Associação Médica do Paraná.